1.过滤阶段：
含尘气体从除尘器的进风口进入，首先经过预收尘机构（如斜板、挡板等），这些机构可以使气流速度减慢，同时利用惯性作用使气体中的粗颗粒粉尘直接落入灰斗。
随后，气体通过滤袋过滤区。滤袋通常由纤维材料制成，具有良好的过滤性能。气体穿过滤袋时，粉尘被阻留在滤袋的外表面，而净化后的气体则进入上箱体，并通过净气集合管和排风道，然后由排风机排至大气。
2.清灰阶段：
随着过滤时间的延长，滤袋上的粉尘层不断增厚，除尘器的阻力也逐渐上升。当阻力达到设定值时，清灰装置开始工作。
清灰过程通常分为分室离线清灰和在线清灰两种方式。分室离线清灰是先关闭该室的净气出口风道，使该室的滤袋处于无气流通过的状态，然后开启脉冲阀用压缩空气进行脉冲喷吹清灰。在线清灰则是在滤袋持续过滤的同时进行清灰，但这种方式对除尘器的性能和滤袋的寿命有影响。
脉冲喷吹清灰是通过压缩空气在短时间内释放大量能量，形成高压气流，这股气流以较高的速度通过喷嘴射向滤袋，使滤袋急剧膨胀，产生强烈的振动，从而将附着在滤袋外表面的粉尘抖落。
清灰完毕后，电磁脉冲阀关闭，提升阀（或切换阀）打开，该室又恢复过滤状态。清灰各室依次进行，从一室清灰开始至下一次清灰开始为一个清灰周期。
3.排灰阶段：
落入灰斗的粉尘通过排灰装置（如星型卸灰阀、螺旋输送机等）定期排出除尘器。排灰装置的选择应根据粉尘的性质、浓度和除尘器的结构来确定。
4.监控与维护：
在脉冲除尘器的运行过程中，需要定期监控除尘效率、阻力变化、滤袋状况等参数，以确保除尘器的正常运行和除尘。
同时，还需要定期对除尘器进行维护和保养，包括检查滤袋的磨损情况、更换损坏的滤袋、清理灰斗内的积灰等。